在二手房交易中，办理手续的过程因付款方式不同而存在差异。房产交易的付款方式主要包括全款、商业贷款、公积金贷款以及组合贷款。
全款交易的整个过户流程相对简单：买卖双方在确认所有交易条件后签署购房合同并支付定金。随后进行购房资格审核和房屋出售审核，接着进行网上签约（网签）。紧接着，办理资金监管，即买受方支付购房款至监管账户。然后是缴税过户、物业交割（交房），领取房产证，监管账户房款解冻（卖方收到房款），最后完成交易。
商业贷款和公积金贷款的流程相对较为繁琐。
商业贷款的流程包括：买卖双方商谈好交易条件后签署购房合同并支付定金。然后进行购房资格审查和房屋出售审核，接着办理网上签约（网签）。随后，银行委托评估公司对交易房屋进行现值评估。买卖双方前往银行面签，银行审批通过后办理资金监管。买方支付首付款至监管账户，银行发放贷款至监管账户。然后进行缴税过户、物业交割，领取房产证，监管账户房款解冻（卖方收到房款），买方办理抵押登记，银行领取他项权利证，最终完成交易。
公积金贷款的流程如下：
买卖双方商定好所有的交易条件后，就签订买卖合同并支付定金。接着，双方进行购房资格审核和房屋出售审核，进行评估工作。然后办理网上签约（网签），资金监管开始，买方支付首付款至监管账户。接下来是公积金面签和贷款审批，待贷款批准后，资金放款至监管账户。然后进行缴税过户和物业交割。紧接着，买方领取新的房产证，资金解冻（卖方收到房款），进行抵押登记和出他项权利证。
关于公积金贷款年限的确定：根据借款人年龄计算，男性以64周岁、女性以59周岁为准；同时考虑房龄，贷款最长时间以30年减去房龄为准。
对于商业贷款的年限，男性通常在65周岁，某些银行可放宽至70周岁；女性一般在60周岁，某些银行可放宽至65周岁。
针对二手房交易的手续费，主要包括增值税、契税、个税、评估费、代办按揭费和中介费。其中，增值税税率为5.3%，房产证满两年后可免征。个税税率为1%，房产证满五年并且为产权人所在省份的唯一住宅可免征。契税方面，90平米及以下的首套房税率为1%，二套房为1%；90平米以上的首套房税率为1.5%，二套房为2%。现在很多城市都实行限购政策，家庭单位一般不能拥有超过两套住宅，所以基本不涉及三套房及以上的交易契税。
金融机构通常会收取评估费和代办按揭费，收费标准各有不同，一般按照办理的事项来收费。
