刑事拘留后查明无罪会怎样处理

依据刑事诉讼法，被刑拘后最终被认定无罪有不同处理。侦查阶段，公安机关应撤销案件并释放嫌疑人；审查起诉阶段，检察院认为无犯罪事实等应不起诉并释放；审判阶段，法院认定无罪应作无罪判决并释放。此外，被错误刑拘者有权申请国家赔偿，赔偿义务机关一般是作出拘留决定的机关。