劳动合同体现双方意思自治的基本原则，在不违反法律法规的前提下，经由劳动者本人签字确认的条款是有约束力的。可能被认定为用人单位支付工资中已包含加班费的情形有3种：
1.经由双方签字盖章确认的劳动合同中有所约定的；
2.薪资制度中此规定，且经由民主程序制定，并依法公示或告知劳动者本人；
3.经由劳动者本人确认的工资结构表中能够体现用人单位实际支付了加班费的。
如果劳动者在包含“工资中已包含加班费”条款的劳动合同或者员工手册等书面协议上，或者在能够证明用人单位已支付工资中包含加班费的工资条签字确认了的，再想主张加班费会比正常情况更加困难。
引用法条
中华人民共和国劳动合同法
